Beim Putzen der gläsernen Wand- und Deckenelemente muss darauf geachtet werden, dass die unteren Randbereiche sorgfältig gesäubert werden, besonders von außen. Durch die Schwerkraft bedingt sammelt sich nämlich da der meiste Schmutz an, begünstigt durch das Herunterlaufen von Regen und Tau. Müssen Fenster und isolierende Elemente von Moos befreit werden, so dürfen dabei keine scharfkantigen Gegenstände verwendet werden da diese sowohl das Glas als auch die Isolierabdichtungen beschädigen könnten.

Sollten sich in einigen Ecken dennoch Ablagerungen gesammelt haben, die nur sehr schwer zu entfernen sind, kann der konzentrierte Wasserstrahl eines Hochdruckreinigers den gewünschten Reinigungseffekt erzielen. Auch Dampfreiniger können zur Wintergarten-Reinigung eingesetzt werden. Diese erzielen ganz ohne den Einsatz von laugen oder Seifen gute Ergebnisse.